​Cuối năm 1954, Cha Đaminh Lương Trí Thức đưa khoảng 1.000 giáo dân thuộc hai Giáo phận Bùi Chu và Phát Diệm đến cây số 15, quốc lộ 1A để lập nghiệp và hình thành Giáo xứ Bùi Chu. Thời gian đầu, Cha Đaminh và cộng đoàn Bùi Chu dựng một nhà nguyện bằng gỗ, mái lá để quây quần đọc kinh, cầu nguyện và dâng lễ. Năm 1964, Cha Andrê Đoàn Thanh Điện về làm chánh xứ Bùi Chu. Trong giai đoạn từ năm 1964 đến năm 1975, Cha Andrê đã xây dựng nhà thờ mới, quy hoạch nghĩa trang và xây đài Đức Mẹ. Năm 1975, Cha Giuse Đệ Nguyễn Văn Thanh kế nhiệm Cha Andrê phụ trách Giáo xứ Bùi Chu. Năm 1988, Cha Giuse Đệ đã xây dựng nhà thờ với hình dáng kiến trúc mới. Sau nhiều lần thay đổi và xây dựng, Giáo xứ Bùi Chu có một ngôi thánh đường khang trang, bề thế và tháp chuông được xây dựng bằng bêtông cốt thép (khánh thành ngày 19.02.1989). Ngoài ra, Giáo xứ Bùi Chu còn có nhà nguyện Mân Côi thuộc họ Thánh Tâm thuận tiện cho việc quy tụ đọc kinh cầu nguyện. Năm 2004, Cha Giuse Đinh Nam Hưng thay thế Cha Giuse Đệ phụ trách Giáo xứ. Cha Giuse đã xây nhà mục vụ và nhà giáo lý, cũng như giúp cộng đoàn Bùi Chu đi vào ổn định, nề nếp .

Ngày 08/09/2020 Cha Giuse Đoàn Công Bình được bổ nhiệm tiếp tục coi sóc Giáo xứ.

​